dan cara penyebaran infeksi bisa berbeda.Kolonisasi yang dimediasi oleh patogen sebenarnya dapat terjadi melalui:
- Rute ascending dari kandung kemih (paling sering): dari perineum (atau dari ruang depan vagina, dalam kasus pasien wanita), mikroorganisme naik di uretra, kemudian di kandung kemih, sampai ke ginjal; penyebab utama Infeksi pada wanita terdiri dari deformasi uretra selama hubungan seksual, sedangkan pada pria sering disebabkan oleh prostatitis.Pada pasien yang dipasangi kateter, kontaminasi dapat terjadi setelah penempatan atau manipulasi kateter, dengan kemungkinan naiknya patogen ke dalam kandung kemih. .
- Rute penurunan darah: melalui aliran darah, selama septikemia, patogen mencapai ginjal menyebabkan nefritis dan abses ginjal.
- Jalur limfatik Descending: jaringan pembuluh limfatik menghubungkan kolon asendens dengan ginjal kanan dan kolon desendens dengan ginjal kiri.
Mikroorganisme yang terlibat dalam pielonefritis biasanya sama bertanggung jawab untuk infeksi saluran kemih, genital dan saluran pencernaan, oleh karena itu di kandung kemih, prostat, leher rahim, vagina, uretra atau rektum: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus sp., Enterococcus spp. dll.
Dalam kebanyakan kasus, patogen ini mewakili bakteri flora tinja, yang mengambil rute menaik meskipun secara umum peristaltik (gerakan kontraksi dan distensi dinding saluran kemih) melakukan "tindakan perlindungan yang efektif terhadap infeksi.
Mikroorganisme lain yang tidak biasa kadang-kadang dilaporkan: mikobakteri, ragi dan jamur, serta patogen oportunistik seperti Corynebacterium urealyticum.
