Sintesis asam amino dan protein biasa
Asam amino yang paling sering muncul dalam struktur protein organisme hidup disebut asam amino biasa atau proteinogenik. Meskipun lebih dari 500 jenis asam amino dikenal di alam, hanya ada dua puluh yang kita sebut biasa. Bersamaan dengan mereka, ada beberapa yang lebih langka, yang disebut sesekali, yang umumnya berasal dari metabolisme yang biasa setelah dimasukkan ke dalam rantai protein. Dalam kolagen, misalnya, lisin dan prolin, dua asam amino biasa, ditemukan dalam bentuk terhidroksilasi (hidroksiprolin dan hidroksilisin).
Sebagian besar asam amino non-biasa lainnya terutama termasuk dalam konstitusi enzim dan hormon yang bersifat protein, atau lebih tepatnya peptida (ingat bahwa untuk dianggap demikian, protein harus terdiri dari lebih dari 100 asam amino, sedangkan untuk membentuk masing-masing oligo dan polipeptida 2 hingga 9 dan 10 hingga 100 sudah cukup).
Di antara 20 asam amino biasa yang diingat
Alanin, Arginin, Asparagin, Asam Aspartat, Sistein, Glisin, Asam Glutamat, Glutamin, Histidin, Isoleusin, Leusin, Lisin, Metionin, Fenilalanin, Prolin, Serin, Treonin, Triptofan, Tirosin, Valin
Contoh asam amino non-biasa adalah:
karnitin (terlibat dalam pengangkutan asam lemak rantai panjang di dalam mitokondria, di mana mereka digunakan untuk menghasilkan energi);
ornithine, citrulline dan homocysteine (berpartisipasi dalam metabolisme asam amino - siklus urea);
hidroksiprolin dan hidroksilisin (mereka adalah bagian dari komposisi kolagen dan beberapa protein);
sarkosin (atau metilglisin).
Beberapa asam amino mungkin juga memiliki kepentingan komersial atau farmakologis.
- Natrium glutamat digunakan dalam industri makanan sebagai penambah rasa (lihat kubus kaldu).
- L-dihydroxyphenylalanine (L-DOPA) adalah obat yang digunakan untuk pengobatan penyakit Parkinson.
- 5-hydroxytryptophan (5-HTP) telah digunakan untuk pengobatan gejala neurologis yang terkait dengan fenilketonuria (penyakit metabolik bawaan yang mencegah penggunaan fenilalanin, asam amino esensial, karena defisit enzim tertentu; akumulasi fenilalanin dalam jaringan bertanggung jawab atas kerusakan kulit dan neurologis yang parah).
Tumbuhan dan bakteri mampu menghasilkan asam amino tertentu, yang dapat ditemukan pada antibiotik peptida, seperti nisin dan alametisin.
Asam amino esensial
Beberapa dari 20 asam amino biasa disebut esensial, karena tidak dapat disintesis oleh tubuh dari senyawa lain, tetapi harus dikonsumsi bersama makanan.
Bagi manusia, ini adalah fenilalanin, leusin, isoleusin, lisin, metionin, treonin, triptofan, valin, dan, pada anak-anak, histidin dan arginin.
Asam amino biasa, karakteristik kimia
Berdasarkan sifat kimia dari radikal R (gugus atom yang membentuk rantai tidak terlalu panjang), asam amino dapat dibagi menjadi berbagai kategori.
Asam amino dengan apolar R (tidak dapat membentuk ikatan hidrogen):
dengan rantai alifatik: alanin, leusin, isoleusin, valin, prolin
dengan rantai aromatik: fenilalanin, triptofan
dengan rantai yang mengandung atom belerang: metionin
Asam amino dengan R polar:
dengan gugus OH: serin, treonin, tirosin
dengan kelompok SH: sistein
dengan gugus CO-NH2: asparagin, glutamin
dengan H: glisin (satu-satunya asam amino non-kiral)
Asam amino dengan basa R:
lisin, arginin, histidin
Asam amino dengan asam R:
asam glutamat, asam aspartat
